Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms