Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI2P10070 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GLI2P10070 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GLI2P10070 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI2P10070 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI2P10070 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI2P10070 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms