Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F13BP05160 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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F13BP05160 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F13BP05160 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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F13BP05160 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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