Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms