Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms