Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms