Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms