Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms