Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-204ENST00000374307 1868 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-215ENST00000524618 1217 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -11e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-205ENST00000424294 756 ntTSL 57.98□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 418.69■□□□□ 0.583e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-203ENST00000518050 718 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-207ENST00000520796 737 ntTSL 517.72■□□□□ 0.432e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-204ENST00000519472 303 ntTSL 217.67■□□□□ 0.422e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-214ENST00000523396 426 ntTSL 317.67■□□□□ 0.422e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-205ENST00000519742 583 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-216ENST00000523589 878 ntTSL 315.43■□□□□ 0.062e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-206ENST00000520491 580 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-212ENST00000522413 654 ntTSL 313.62□□□□□ -0.232e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-217ENST00000560566 1039 ntTSL 412.84□□□□□ -0.352e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-211ENST00000522299 2807 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CLU-210ENST00000522238 791 ntTSL 311.15□□□□□ -0.622e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.73e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.223e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.063e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.943e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.563e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AC074143.1-201ENST00000580114 1287 ntAPPRIS P5 TSL 524.27■■□□□ 1.485e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-206ENST00000448973 1710 ntTSL 1 (best)23.27■■□□□ 1.326e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.045e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-210ENST00000565799 716 ntTSL 320.76■□□□□ 0.916e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.865e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)20.28■□□□□ 0.845e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.815e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.735e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-223ENST00000523270 575 ntTSL 419.44■□□□□ 0.75e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-207ENST00000478398 765 ntTSL 318.95■□□□□ 0.625e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.576e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SRCIN1-216ENST00000621763 5225 ntTSL 218.3■□□□□ 0.523e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-209ENST00000565163 485 ntTSL 318.29■□□□□ 0.526e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-215ENST00000521174 485 ntTSL 518.22■□□□□ 0.515e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-203ENST00000461030 820 ntTSL 517.75■□□□□ 0.435e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-211ENST00000568077 588 ntTSL 317.68■□□□□ 0.426e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-213ENST00000568830 590 ntTSL 317.68■□□□□ 0.426e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.426e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 HSF4-223ENST00000523077 828 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SRCIN1-218ENST00000622519 5204 ntTSL 216.96■□□□□ 0.313e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-212ENST00000568773 499 ntTSL 216.72■□□□□ 0.276e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 216.67■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-205ENST00000518028 516 ntTSL 416.59■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-211ENST00000519430 562 ntTSL 416.59■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-213ENST00000520472 912 ntTSL 516.59■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-209ENST00000481165 4759 ntTSL 216.44■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.226e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.226e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-207ENST00000456420 755 ntTSL 316.33■□□□□ 0.26e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.195e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CFB-272ENST00000452035 1866 ntTSL 216.14■□□□□ 0.176e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-208ENST00000564039 518 ntTSL 216.13■□□□□ 0.176e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 PKDCC-204ENST00000475241 773 ntTSL 316.09■□□□□ 0.176e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SRCIN1-217ENST00000622190 4635 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-221ENST00000522458 623 ntTSL 415.67■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.085e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SRCIN1-212ENST00000613927 1150 ntTSL 315.42■□□□□ 0.063e-10■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AFF1-205ENST00000504956 1668 ntTSL 215.19■□□□□ 0.025e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-208ENST00000519211 620 ntTSL 315.19■□□□□ 0.025e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-203ENST00000517568 692 ntTSL 415.03■□□□□ -05e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-207ENST00000518782 550 ntTSL 415.03■□□□□ -05e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.026e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-206ENST00000518775 920 ntTSL 514.85□□□□□ -0.035e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.066e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AC074143.1-202ENST00000518753 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.66□□□□□ -0.065e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 POLRMT-207ENST00000592633 469 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SPIN2B-204ENST00000434397 1050 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.175e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.25e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 513.72□□□□□ -0.216e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-222ENST00000522644 1027 ntTSL 513.72□□□□□ -0.215e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-209ENST00000519394 500 ntTSL 313.59□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-219ENST00000521729 1068 ntTSL 213.59□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.276e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-215ENST00000445561 2597 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.295e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 LINC01226-204ENST00000639839 554 ntTSL 413.16□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 512.86□□□□□ -0.356e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-212ENST00000519903 648 ntTSL 412.8□□□□□ -0.365e-7■□□□□ 9.2
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