Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCAO15360 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCAO15360 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms