Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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