Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms