Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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