Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms