Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPDC1A2A3K4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPDC1A2A3K4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms