Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms