Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD3Q9P035 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms