Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms