Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms