Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms