Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms