Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms