Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms