Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms