Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms