Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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