Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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