Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms