Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC45A3Q96JT2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms