Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms