Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms