Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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