Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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