Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms