Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.497e-10■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.827e-10■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.957e-10■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 APEH-214ENST00000482301 1041 ntTSL 311.19□□□□□ -0.627e-9■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 GYS1-204ENST00000472004 578 ntTSL 311.5□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPL-205ENST00000595804 588 ntTSL 27.33□□□□□ -1.248e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 519.9■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBXN7-205ENST00000429160 3158 ntTSL 29.15□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.041e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 29□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRSF1-207ENST00000584668 758 ntTSL 37.57□□□□□ -1.28e-11■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 DGKZ-207ENST00000524869 592 ntTSL 419.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 ELP3-215ENST00000523357 874 ntTSL 39.18□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 ELP3-203ENST00000517975 680 ntTSL 31.92□□□□□ -2.14e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 DHX9-202ENST00000473076 1378 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.651e-11■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MTX2-205ENST00000452865 817 ntTSL 320.19■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MTX2-203ENST00000423461 618 ntTSL 319.87■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MTX2-202ENST00000420864 1592 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF167-208ENST00000572554 501 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 511.47□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 CTDSP1-208ENST00000482272 984 ntTSL 211.44□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 HMGN1-217ENST00000489072 1014 ntTSL 321.46■■□□□ 1.034e-11■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UNC45A-214ENST00000556704 1299 ntTSL 511.25□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MRPL55-228ENST00000476267 169 ntTSL 311.32□□□□□ -0.62e-21■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHH1-206ENST00000558386 3383 ntTSL 27.92□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.879e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 ODC1-204ENST00000446285 665 ntTSL 523.02■■□□□ 1.281e-9■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 215.12■□□□□ 0.018e-11■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 KIF22-207ENST00000568312 781 ntTSL 310.13□□□□□ -0.798e-11■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRRM1-212ENST00000479034 2671 ntTSL 56.19□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.763e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K8-205ENST00000415139 1026 ntTSL 311.86□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.146e-9■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 PCCA-213ENST00000636475 1971 ntTSL 57.58□□□□□ -1.26e-9■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 TRMT1-220ENST00000592814 985 ntTSL 313.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 CRELD1-210ENST00000489674 437 ntTSL 511.7□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 47.74□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL18-210ENST00000550671 764 ntTSL 210.67□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 MTG1-207ENST00000495014 871 ntTSL 316.2■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 B4GALT4-215ENST00000480814 2107 ntTSL 57.48□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 ARHGEF18-203ENST00000594665 4616 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 315.94■□□□□ 0.145e-9■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 413.82□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.065e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP214-207ENST00000476004 502 ntTSL 313.11□□□□□ -0.318e-10■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP214-219ENST00000528406 393 ntTSL 311.69□□□□□ -0.548e-10■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP214-211ENST00000498010 483 ntTSL 510.9□□□□□ -0.678e-10■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 27.2
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