Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms