Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms