Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A12Q504Y0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A12Q504Y0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms