Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LTC4SQ16873 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LTC4SQ16873 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTC4SQ16873 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LTC4SQ16873 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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