Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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