Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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