Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms