Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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