Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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