Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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PRKAA1Q13131 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PRKAA1Q13131 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PRKAA1Q13131 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PRKAA1Q13131 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PRKAA1Q13131 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms