Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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