Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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