Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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