Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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