Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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